KCND3

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1S1G, 2NZ0

Ідентифікатори

Символи

KCND3, KCND3L, KCND3S, KSHIVB, KV4.3, SCA19, SCA22, BRGDA9, potassium voltage-gated channel subfamily D member 3

Зовнішні ІД

OMIM: 605411 MGI: 1928743 HomoloGene: 21036 GeneCards: KCND3

Пов'язані генетичні захворювання

натуральна віспа, spinocerebellar ataxia type 19/22, Brugada syndrome 9^[1]

Реагує на сполуку

Гуанідин^[2]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• potassium channel activity • transmembrane transporter binding • зв'язування з іоном металу • voltage-gated ion channel activity • ion channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • voltage-gated potassium channel activity • A-type (transient outward) potassium channel activity • voltage-gated potassium channel activity involved in cardiac muscle cell action potential repolarization • voltage-gated potassium channel activity involved in ventricular cardiac muscle cell action potential repolarization
Клітинна компонента	• integral component of membrane • cell projection • мембрана • voltage-gated potassium channel complex • клітинна мембрана • дендрит (нейробіологія) • Сарколема • GABA-ergic synapse • integral component of postsynaptic specialization membrane • neuronal cell body
Біологічний процес	• regulation of ion transmembrane transport • ion transport • potassium ion transport • membrane repolarization • трансмембранний транспорт • potassium ion transmembrane transport • protein homooligomerization • membrane repolarization during cardiac muscle cell action potential • regulation of heart rate by cardiac conduction • potassium ion export across plasma membrane • membrane repolarization during ventricular cardiac muscle cell action potential • ventricular cardiac muscle cell membrane repolarization • cardiac conduction
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3752


56543

Ensembl


ENSG00000171385


ENSMUSG00000040896

UniProt


Q9UK17


Q9Z0V1

RefSeq (мРНК)


NM_004980 NM_172198 NM_001378969 NM_001378970


NM_001039347 NM_019931

RefSeq (білок)


NP_004971 NP_751948 NP_001365898 NP_001365899


NP_001034436 NP_064315

Локус (UCSC)

Хр. 1: 111.77 – 111.99 Mb

Хр. 3: 105.36 – 105.58 Mb

PubMed search

^[3]

^[4]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

KCND3 (англ. Potassium voltage-gated channel subfamily D member 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 655 амінокислот, а молекулярна маса — 73 451^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAGVAAWLP	FARAAAIGWM	PVANCPMPLA	PADKNKRQDE	LIVLNVSGRR
FQTWRTTLER	YPDTLLGSTE	KEFFFNEDTK	EYFFDRDPEV	FRCVLNFYRT
GKLHYPRYEC	ISAYDDELAF	YGILPEIIGD	CCYEEYKDRK	RENAERLMDD
NDSENNQESM	PSLSFRQTMW	RAFENPHTST	LALVFYYVTG	FFIAVSVITN
VVETVPCGTV	PGSKELPCGE	RYSVAFFCLD	TACVMIFTVE	YLLRLFAAPS
RYRFIRSVMS	IIDVVAIMPY	YIGLVMTNNE	DVSGAFVTLR	VFRVFRIFKF
SRHSQGLRIL	GYTLKSCASE	LGFLLFSLTM	AIIIFATVMF	YAEKGSSASK
FTSIPASFWY	TIVTMTTLGY	GDMVPKTIAG	KIFGSICSLS	GVLVIALPVP
VIVSNFSRIY	HQNQRADKRR	AQKKARLARI	RVAKTGSSNA	YLHSKRNGLL
NEALELTGTP	EEEHMGKTTS	LIESQHHHLL	HCLEKTTGLS	YLVDDPLLSV
RTSTIKNHEF	IDEQMFEQNC	MESSMQNYPS	TRSPSLSSHP	GLTTTCCSRR
SKKTTHLPNS	NLPATRLRSM	QELSTIHIQG	SEQPSLTTSR	SSLNLKADDG
LRPNCKTSQI	TTAIISIPTP	PALTPEGESR	PPPASPGPNT	NIPSIASNVV
KVSAL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт калію, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, калію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних відростках.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Deschenes I., Tomaselli G.F. (2002). Modulation of Kv4.3 current by accessory subunits. FEBS Lett. 528: 183—188. PMID 12297301 DOI:10.1016/S0014-5793(02)03296-9
Dilks D., Ling H.-P., Cockett M., Sokol P., Numann R. (1999). Cloning and expression of the human Kv4.3 potassium channel. J. Neurophysiol. 81: 1974—1977. PMID 10200233

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з KCND3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Potassium voltage-gated channel subfamily D member 3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6239 (англ.) . Архів оригіналу за 23 липня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9UK17 (англ.) . Архів оригіналу за 14 липня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані