CLCA4

Ідентифікатори

Символи

CLCA4, CaCC, CaCC2, chloride channel accessory 4

Зовнішні ІД

OMIM: 616857 MGI: 2139744 HomoloGene: 40808 GeneCards: CLCA4

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0070122 peptidase activity • hydrolase activity • metallopeptidase activity • зв'язування з іоном металу • chloride channel activity • metalloendopeptidase activity • intracellular calcium activated chloride channel activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • extracellular region • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • apical plasma membrane • мембрана
Біологічний процес	• ion transmembrane transport • chloride transport • протеоліз • chloride transmembrane transport
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


22802


99663

Ensembl


ENSG00000016602


ENSMUSG00000068547

UniProt


Q14CN2


Q6Q473

RefSeq (мРНК)


NM_012128


NM_207208

RefSeq (білок)


NP_036260


NP_997091

Локус (UCSC)

Хр. 1: 86.55 – 86.58 Mb

Хр. 3: 144.66 – 144.68 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CLCA4 (англ. Chloride channel accessory 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 919 амінокислот, а молекулярна маса — 101 283^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGLFRGFVFL	LVLCLLHQSN	TSFIKLNNNG	FEDIVIVIDP	SVPEDEKIIE
QIEDMVTTAS	TYLFEATEKR	FFFKNVSILI	PENWKENPQY	KRPKHENHKH
ADVIVAPPTL	PGRDEPYTKQ	FTECGEKGEY	IHFTPDLLLG	KKQNEYGPPG
KLFVHEWAHL	RWGVFDEYNE	DQPFYRAKSK	KIEATRCSAG	ISGRNRVYKC
QGGSCLSRAC	RIDSTTKLYG	KDCQFFPDKV	QTEKASIMFM	QSIDSVVEFC
NEKTHNQEAP	SLQNIKCNFR	STWEVISNSE	DFKNTIPMVT	PPPPPVFSLL
KISQRIVCLV	LDKSGSMGGK	DRLNRMNQAA	KHFLLQTVEN	GSWVGMVHFD
STATIVNKLI	QIKSSDERNT	LMAGLPTYPL	GGTSICSGIK	YAFQVIGELH
SQLDGSEVLL	LTDGEDNTAS	SCIDEVKQSG	AIVHFIALGR	AADEAVIEMS
KITGGSHFYV	SDEAQNNGLI	DAFGALTSGN	TDLSQKSLQL	ESKGLTLNSN
AWMNDTVIID	STVGKDTFFL	ITWNSLPPSI	SLWDPSGTIM	ENFTVDATSK
MAYLSIPGTA	KVGTWAYNLQ	AKANPETLTI	TVTSRAANSS	VPPITVNAKM
NKDVNSFPSP	MIVYAEILQG	YVPVLGANVT	AFIESQNGHT	EVLELLDNGA
GADSFKNDGV	YSRYFTAYTE	NGRYSLKVRA	HGGANTARLK	LRPPLNRAAY
IPGWVVNGEI	EANPPRPEID	EDTQTTLEDF	SRTASGGAFV	VSQVPSLPLP
DQYPPSQITD	LDATVHEDKI	ILTWTAPGDN	FDVGKVQRYI	IRISASILDL
RDSFDDALQV	NTTDLSPKEA	NSKESFAFKP	ENISEENATH	IFIAIKSIDK
SNLTSKVSNI	AQVTLFIPQA	NPDDIDPTPT	PTPTPTPDKS	HNSGVNISTL
VLSVIGSVVI	VNFILSTTI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, хлоридом. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

Agnel M., Vermat T., Culouscou J.-M. (1999). Identification of three novel members of the calcium-dependent chloride channel (CaCC) family predominantly expressed in the digestive tract and trachea. FEBS Lett. 455: 295—301. PMID 10437792 DOI:10.1016/S0014-5793(99)00891-1
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2018 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q14CN2 (англ.) . Архів оригіналу за 29 квітня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані