CLCNKA

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2PFI

Ідентифікатори

Символи

CLCNKA, CLCK1, ClC-K1, hClC-Ka, chloride voltage-gated channel Ka

Зовнішні ІД

OMIM: 602024 MGI: 1930643 HomoloGene: 107317 GeneCards: CLCNKA

Пов'язані генетичні захворювання

Bartter disease type 4b^[1]

Реагує на сполуку

niflumic acid, DIDS^[2]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу • voltage-gated ion channel activity • chloride channel activity • voltage-gated chloride channel activity • identical protein binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • chloride channel complex • мембрана
Біологічний процес	• ion transmembrane transport • chloride transport • виділення • regulation of ion transmembrane transport • ion transport • трансмембранний транспорт • chloride transmembrane transport
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1187


56365

Ensembl


ENSG00000186510


ENSMUSG00000006216

UniProt


P51800


Q9WUB6

RefSeq (мРНК)


NM_004070 NM_001042704 NM_001257139


NM_019701

RefSeq (білок)


NP_001036169 NP_001244068 NP_004061


NP_062675

Локус (UCSC)

Хр. 1: 16.02 – 16.03 Mb

Хр. 4: 141.13 – 141.14 Mb

PubMed search

^[3]

^[4]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CLCNKA (англ. Chloride voltage-gated channel Ka) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 687 амінокислот, а молекулярна маса — 75 285^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEELVGLREG	FSGDPVTLQE	LWGPCPHIRR	AIQGGLEWLK	QKVFRLGEDW
YFLMTLGVLM	ALVSYAMNFA	IGCVVRAHQW	LYREIGDSHL	LRYLSWTVYP
VALVSFSSGF	SQSITPSSGG	SGIPELKTML	AGVILEDYLD	IKNFGAKVVG
LSCTLATGST	LFLGKVGPFV	HLSVMIAAYL	GRVRTTTIGE	PENKSKQNEM
LVAAAAVGVA	TVFAAPFSGV	LFSIEVMSSH	FSVRDYWRGF	FAATCGAFIF
RLLAVFNSEQ	ETITSLYKTS	FRVDVPFDLP	EIFFFVALGG	ICGVLSCAYL
FCQRTFLSFI	KTNRYSSKLL	ATSKPVYSAL	ATLLLASITY	PPGVGHFLAS
RLSMKQHLDS	LFDNHSWALM	TQNSSPPWPE	ELDPQHLWWE	WYHPRFTIFG
TLAFFLVMKF	WMLILATTIP	MPAGYFMPIF	ILGAAIGRLL	GEALAVAFPE
GIVTGGVTNP	IMPGGYALAG	AAAFSGAVTH	TISTALLAFE	LTGQIVHALP
VLMAVLAANA	IAQSCQPSFY	DGTIIVKKLP	YLPRILGRNI	GSHHVRVEHF
MNHSITTLAK	DTPLEEVVKV	VTSTDVTEYP	LVESTESQIL	VGIVQRAQLV
QALQAEPPSR	APGHQQCLQD	ILARGCPTEP	VTLTLFSETT	LHQAQNLFKL
LNLQSLFVTS	RGRAVGCVSW	VEMKKAISNL	TNPPAPK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів, хлорних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, хлоридом. Локалізований у мембрані.

Література

Kieferle S., Fong P., Bens M., Vandewalle A., Jentsch T. (1994). Two highly homologous members of the ClC chloride channel family in both rat and human kidney. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 6943—6947. PMID 8041726 DOI:10.1073/pnas.91.15.6943
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Gradogna A., Fenollar-Ferrer C., Forrest L.R., Pusch M. (2012). Dissecting a regulatory calcium-binding site of CLC-K kidney chloride channels. J. Gen. Physiol. 140: 681—696. PMID 23148261 DOI:10.1085/jgp.201210878
Markovic S., Dutzler R. (2007). The structure of the cytoplasmic domain of the chloride channel ClC-Ka reveals a conserved interaction interface. Structure. 15: 715—725. PMID 17562318 DOI:10.1016/j.str.2007.04.013

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з CLCNKA переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Chloride voltage-gated channel Ka переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2026 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
↑ UniProt, P51800 (англ.) . Архів оригіналу за 3 грудня 2016. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані