GPR98

G protein spregnuti receptor 98

Identifikatori

GPR98; FEB4; MASS1; USH2B; USH2C; VLGR1; VLGR1b

Vanjski ID

OMIM: 602851 MGI: 1274784 HomoloGene: 19815 IUPHAR: GPR98 GeneCards: GPR98 Gene

Ontologija gena
Molekularna funkcija	• aktivnost G protein spregnutog receptora • vezivanje jona kalcijuma • proteinsko vezivanje • miozinsko vezivanje
Celularna komponenta	• integralno sa ćelijskom membranom • integralno sa membranom
Biološki proces	• signalni put G protein spregnutog receptora • neuropeptidni signalni put • razvoj nervnog sistema • senzorna percepcija zvuka • međućelijska adhezija

Pregled RNK izražavanja

podaci

Ortolozi

Vrsta

Čovek

Miš

Entrez

84059

110789

Ensembl

ENSG00000164199

ENSMUSG00000069170

UniProt

Q8WXG9

Q8VHN7

RefSeq (mRNA)

NM_032119.3

NM_054053.4

RefSeq (protein)

NP_115495.3

NP_473394.3

Lokacija (UCSC)

Chr 5:
89.83 - 90.46 Mb

Chr 13:
81.23 - 81.77 Mb

PubMed pretraga

[1]

[2]

G protein spregnuti receptor 98 je protein koji je kod ljudi kodiran GPR98 genom.^[1]

Ovaj protein je član familije G protein spregnutih receptora. On vezuje kalcijum. Izražen je u centralnom nervnom sistemu. On je takođe poznat kao veoma veliki G-protein spregnuti receptor 1, jer je 6300 aminokiselina dug. On sadrži C-terminus 7-transmembranaskog domena uobičajene dužine, dok N-terminus ima 5900 ostataka uključujući 35 kalks-beta domena vezivanja kalcijuma, i 6 EAR domena. Mutacije ovog gena su asocirane sa Ušerovim sindromom 2. Nekoliko alternativno splajsovanih transkripta je opisano.^[1]

Reference

^ ^а ^б „Entrez Gene: GPR98 G protein-coupled receptor 98”.

Literatura

Nakajima D; Okazaki N; Yamakawa H; et al. (2003). „Construction of expression-ready cDNA clones for KIAA genes: manual curation of 330 KIAA cDNA clones.”. DNA Res. 9 (3): 99—106. PMID 12168954. doi:10.1093/dnares/9.3.99. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
Staub E; Pérez-Tur J; Siebert R; et al. (2002). „The novel EPTP repeat defines a superfamily of proteins implicated in epileptic disorders.”. Trends Biochem. Sci. 27 (9): 441—4. PMID 12217514. doi:10.1016/S0968-0004(02)02163-1. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
Ishikawa K; Nagase T; Suyama M; et al. (1998). „Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. X. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which can code for large proteins in vitro.”. DNA Res. 5 (3): 169—76. PMID 9734811. doi:10.1093/dnares/5.3.169. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
Nakayama J; Hamano K; Iwasaki N; et al. (2000). „Significant evidence for linkage of febrile seizures to chromosome 5q14-q15.”. Hum. Mol. Genet. 9 (1): 87—91. PMID 10587582. doi:10.1093/hmg/9.1.87. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
Pieke-Dahl S; Möller CG; Kelley PM; et al. (2000). „Genetic heterogeneity of Usher syndrome type II: localisation to chromosome 5q.”. J. Med. Genet. 37 (4): 256—62. PMC 1734554 . PMID 10745043. doi:10.1136/jmg.37.4.256. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
Nikkila H; McMillan DR; Nunez BS; et al. (2001). „Sequence similarities between a novel putative G protein-coupled receptor and Na+/Ca2+ exchangers define a cation binding domain.”. Mol. Endocrinol. 14 (9): 1351—64. PMID 10976914. doi:10.1210/me.14.9.1351. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
Wiemann S; Weil B; Wellenreuther R; et al. (2001). „Toward a catalog of human genes and proteins: sequencing and analysis of 500 novel complete protein coding human cDNAs.”. Genome Res. 11 (3): 422—35. PMC 311072 . PMID 11230166. doi:10.1101/gr.GR1547R. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
Skradski SL; Clark AM; Jiang H; et al. (2001). „A novel gene causing a mendelian audiogenic mouse epilepsy.”. Neuron. 31 (4): 537—44. PMID 11545713. doi:10.1016/S0896-6273(01)00397-X. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
McMillan DR, Kayes-Wandover KM, Richardson JA, White PC (2002). „Very large G protein-coupled receptor-1, the largest known cell surface protein, is highly expressed in the developing central nervous system.”. J. Biol. Chem. 277 (1): 785—92. PMID 11606593. doi:10.1074/jbc.M108929200.
Nagase T, Kikuno R, Ohara O (2002). „Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XXII. The complete sequences of 50 new cDNA clones which code for large proteins.”. DNA Res. 8 (6): 319—27. PMID 11853319. doi:10.1093/dnares/8.6.319.
Nakayama J; Fu YH; Clark AM; et al. (2002). „A nonsense mutation of the MASS1 gene in a family with febrile and afebrile seizures.”. Ann. Neurol. 52 (5): 654—7. PMID 12402266. doi:10.1002/ana.10347. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
Strausberg RL; Feingold EA; Grouse LH; et al. (2003). „Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences.”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899—903. PMC 139241 . PMID 12477932. doi:10.1073/pnas.242603899. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
Ota T; Suzuki Y; Nishikawa T; et al. (2004). „Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs.”. Nat. Genet. 36 (1): 40—5. PMID 14702039. doi:10.1038/ng1285. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
Weston MD; Luijendijk MW; Humphrey KD; et al. (2004). „Mutations in the VLGR1 gene implicate G-protein signaling in the pathogenesis of Usher syndrome type II.”. Am. J. Hum. Genet. 74 (2): 357—66. PMC 1181933 . PMID 14740321. doi:10.1086/381685. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
Bjarnadóttir TK; Fredriksson R; Höglund PJ; et al. (2005). „The human and mouse repertoire of the adhesion family of G-protein-coupled receptors.”. Genomics. 84 (1): 23—33. PMID 15203201. doi:10.1016/j.ygeno.2003.12.004. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
Fu GK; Wang JT; Yang J; et al. (2005). „Circular rapid amplification of cDNA ends for high-throughput extension cloning of partial genes.”. Genomics. 84 (1): 205—10. PMID 15203218. doi:10.1016/j.ygeno.2004.01.011. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
Schwartz SB; Aleman TS; Cideciyan AV; et al. (2005). „Disease expression in Usher syndrome caused by VLGR1 gene mutation (USH2C) and comparison with USH2A phenotype.”. Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 46 (2): 734—43. PMID 15671307. doi:10.1167/iovs.04-1136. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
Kimura K; Wakamatsu A; Suzuki Y; et al. (2006). „Diversification of transcriptional modulation: large-scale identification and characterization of putative alternative promoters of human genes.”. Genome Res. 16 (1): 55—65. PMC 1356129 . PMID 16344560. doi:10.1101/gr.4039406. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)

Spoljašnje veze

GeneReviews/NCBI/NIH/UW entry on Usher Syndrome Type II

Transmembranski receptor: receptori spregnuti s G proteinom

Klasa A: Rodopsinu slični

Neurotransmiter

Adrenergički	α1 (A, B, D) • α2 (A, B, C) • β1 • β2 • β3
Purinski	Adenozinski (A1, A2A, A2B, A3) • P2Y (1, 2, 4, 5, 6, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14)
Serotoninski	(svi osim 5-HT3) 5-HT1 (A, B, D, E, F) • 5-HT2 (A, B, C) • 5-HT (4, 5A, 6, 7)
Drugi	Acetilholin (M1, M2, M3, M4, M5) • Dopamin (D1, D2, D3, D4, D5) • Histamin (H1, H2, H3, H4) • Melatonin (1A, 1B, 1C) • TAAR (1, 2, 3, 5, 6, 8, 9)

Metaboliti i
signalni molekuli

Eikozanoidni	CysLT (1, 2) • LTB4 (1, 2) • FPRL1 • OXE • Prostaglandin (DP (1, 2), EP (1, 2, 3, 4), FP) • Prostaciklin • Tromboksan
Drugi	Žučna kiselina • Kanabinoidni (CB1, CB2, GPR (18, 55, 119)) • EBI2 • Estrogen • Slobodna masna kiselina (1, 2, 3, 4) • Laktat • Lizofosfatidna kiselina (1, 2, 3, 4, 5, 6) • Lizofosfolipid (1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8) • Niacin (1, 2) • Oksoglutarat • PAF • Sfingozin-1-fosfat (1, 2, 3, 4, 5) • Sukcinat

Peptid

Neuropeptidni

B/W (1, 2) • FF (1, 2) • S • Y (1, 2, 4, 5) • Neuromedin (B, U (1, 2)) • Neurotenzin (1, 2)

Drugi

Anafilatoksin (C3a, C5a) • Angiotenzin (1, 2) • Apelin • Bombezin (BRS3, GRPR, NMBR) • Bradikinin (B1, B2) • Hemokin • Holecistokinin (A, B) • Endotelin (A, B) • Formil peptid (1, 2, 3) • FSH • Galanin (1, 2, 3) • GHB receptor • Gonadotropin-oslobađajući hormon (1, 2) • Grelin • Kispeptin • Luteinizirajući hormon/horiogonadotropin • MAS (1, 1L, D, E, F, G, X1, X2, X3, X4) • Melanokortin (1, 2, 3, 4, 5) • MCHR (1, 2) • Motilin • Opioidni (δ, κ, μ, Nociceptin & ζ, ali ne σ) • Oreksin (1, 2) • Oksitocin • Prokineticin (1, 2) • Prolaktin-oslobađajući peptid • Relaksin (1, 2, 3, 4) • Somatostatin (1, 2, 3, 4, 5) • Tahikinin (1, 2, 3) • Tirotropin • Tirotropin-oslobađajući hormon • Urotenzin-II • Vazopresin (1A, 1B, 2)

Razno

Orfan	GPR (1, 3, 4, 6, 12, 15, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 25, 26, 27, 31, 32, 33, 34, 35, 37, 39, 42, 44, 45, 50, 52, 55, 61, 62, 63, 65, 68, 75, 77, 78, 81, 82, 83, 84, 85, 87, 88, 92, 101, 103, 109A, 109B, 119, 120, 132, 135, 137B, 139, 141, 142, 146, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 160, 161, 162, 171, 173, 174, 176, 177, 182, 183)
Drugi	Adrenomedulin • Mirisni • Opsin (3, 4, 5, 1LW, 1MW, 1SW, RGR, RRH) • Proteazom-aktivirani (1, 2, 3, 4) • SREB (1, 2, 3)

Klasa B: Sekretinu slični

Orfan	GPR (56, 64, 97, 98, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 123, 124, 125, 126, 128, 133, 143, 144, 155, 157)
Drugi	Moždano specifični angiogenezni inhibitor (1, 2, 3) • Kadherin (1, 2, 3) • Kalcitonin • CALCRL • CD97 • Kortikotropin-oslobađajući hormon (1, 2) • EMR (1, 2, 3) • Glukagon (GR, GIPR, GLP1R, GLP2R) • Hormon rasta • PACAPR1 • GPR • Latrofilin (1, 2, 3, ELTD1) • Metuzalemski protein • Paratiroidni hormon (1, 2) • Sekretin • Vazoaktivni intestinalni peptid (1, 2)

Klasa C: Metabotropni
glutamat / feromon

Ukus	TAS1R (1, 2, 3) • TAS2R (1, 3, 4, 5, 8, 9, 10, 12, 13, 14, 16, 19, 20, 30, 31, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 45, 46, 50)
Drugi	Kalcijum-detektujući receptor • GABA B (1, 2) • Glutamatni receptor (Metabotropni glutamat (1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8)) • GPRC6A • GPR (156, 158, 179) • RAIG (1, 2, 3, 4) • VNR (1, 2, 3, 5)