CELSR1

Kadherinski, EGF LAG sedmoprolazni G-tip receptor 1 (flamingo homolog, Drosofila)

Identifikatori

CELSR1; CDHF9; FMI2; HFMI2; ME2

Vanjski ID

OMIM: 604523 MGI: 1100883 HomoloGene: 7665 IUPHAR: CELSR1 GeneCards: CELSR1 Gene

Ontologija gena
Molekularna funkcija	• aktivnost G protein spregnutog receptora • proteinsko vezivanje • vezivanje jona kalcijuma • aktivnost proteinske dimerizacije
Celularna komponenta	• membrane frakcija • integral sa ćelijskom membranom • integralno sa membranom • citoplazma • lizozomna membrana
Biološki proces	• uspostavljanje planarne polarnosti • neuronska migracija • zatvaranje neuronske cevi • razvoj folikula kose

Pregled RNK izražavanja

podaci

Ortolozi

Vrsta

Čovek

Miš

Entrez

9620

12614

Ensembl

ENSG00000075275

ENSMUSG00000016028

UniProt

Q9NYQ6

O35161

RefSeq (mRNA)

NM_014246.1

NM_009886.2

RefSeq (protein)

NP_055061.1

NP_034016.2

Lokacija (UCSC)

Chr 22:
46.76 - 46.93 Mb

Chr 15:
85.73 - 85.86 Mb

PubMed pretraga

[1]

[2]

Kadherinski EGF LAG sedmoprolazni G-tip receptor 1 (flamingo homolog 2 ili član 9 kadherinske familije) je protein koji je kod ljudi kodiran CELSR1 genom.^[1]^[2]

Funkcija

Protein kodiran ovim genom je član flamingo potfamilije, koja je deo kadherinske superfamilije. Flamingo potfamilija se sastoji od neklasičnog tipa kadherina. Ta grupa ne formira interakcije sa kateninima. Flamingo kadherini su locirani u ćelijskoj membrani i imaju devet kadherinskih domena, sedam epidermalnom faktoru rasta sličnih ponavljanja i dva laminin A G-tip ponavljanja u njihovom ektodomenu. Oni takođe imaju sedam transmembranskih domena, koji su karakteristični za ovu potfamiliju. Smatra se da su ovi proteini receptori koji učestvuju u kontaktom posredovanoj komunikaciji. Kadherinski domeni deluju kao homofilni vezujući regioni i EGF-slični domeni koji učestvuju u ćelijskoj adheziji i receptor-ligand interakcijama. CELSR1 je razvojno regulisan, neuralno-specifični gen koji ima nepoznatu ulogu u ranoj embriogenezi.^[2]

Reference

^ Hadjantonakis AK, Sheward WJ, Harmar AJ, de Galan L, Hoovers JM, Little PF (1997). „Celsr1, a neural-specific gene encoding an unusual seven-pass transmembrane receptor, maps to mouse chromosome 15 and human chromosome 22qter”. Genomics. 45 (1): 97—104. PMID 9339365. doi:10.1006/geno.1997.4892.
^ ^а ^б „Entrez Gene: CELSR1 cadherin, EGF LAG seven-pass G-type receptor 1 (flamingo homolog, Drosophila)”.

Literatura

Nollet F, Kools P, van Roy F (2000). „Phylogenetic analysis of the cadherin superfamily allows identification of six major subfamilies besides several solitary members”. J. Mol. Biol. 299 (3): 551—72. PMID 10835267. doi:10.1006/jmbi.2000.3777.
Wu Q, Maniatis T (1999). „A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes”. Cell. 97 (6): 779—90. PMID 10380929. doi:10.1016/S0092-8674(00)80789-8.
Dunham, I.; Shimizu, N.; Roe, B. A.; et al. (1999). „The DNA sequence of human chromosome 22”. Nature. 402 (6761): 489—95. PMID 10591208. doi:10.1038/990031.
Wu Q, Maniatis T (2000). „Large exons encoding multiple ectodomains are a characteristic feature of protocadherin genes”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97 (7): 3124—9. PMC 16203 . PMID 10716726. doi:10.1073/pnas.060027397.
Ghosh A (2000). „Dentritic growth: don't go says flamingo”. Neuron. 28 (1): 3—4. PMID 11086974. doi:10.1016/S0896-6273(00)00076-3.
Gross, J.; Grimm, O.; Ortega, G.; et al. (2002). „Mutational analysis of the neuronal cadherin gene CELSR1 and exclusion as a candidate for catatonic schizophrenia in a large family”. Psychiatr. Genet. 11 (4): 197—200. PMID 11807409. doi:10.1097/00041444-200112000-00003.
Strausberg, R. L.; Feingold, E. A.; Grouse, L. H.; et al. (2003). „Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899—903. PMC 139241 . PMID 12477932. doi:10.1073/pnas.242603899.
Georgieva, L.; Nikolov, I.; Poriazova, N.; et al. (2004). „Genetic variation in the seven-pass transmembrane cadherin CELSR1: lack of association with schizophrenia”. Psychiatr. Genet. 13 (2): 103—6. PMID 12782967. doi:10.1097/01.ypg.0000057486.14812.03.
Gerhard, D. S.; Wagner, L.; Feingold, E. A.; et al. (2004). „The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)”. Genome Res. 14 (10B): 2121—7. PMC 528928 . PMID 15489334. doi:10.1101/gr.2596504.
Carroll, J. S.; Liu, X. S.; Brodsky, A. S.; et al. (2005). „Chromosome-wide mapping of estrogen receptor binding reveals long-range regulation requiring the forkhead protein FoxA1”. Cell. 122 (1): 33—43. PMID 16009131. doi:10.1016/j.cell.2005.05.008.

Vidi još

Flamingo (protein)

Transmembranski receptor: receptori spregnuti s G proteinom

Klasa A: Rodopsinu slični

Neurotransmiter

Adrenergički	α1 (A, B, D) • α2 (A, B, C) • β1 • β2 • β3
Purinski	Adenozinski (A1, A2A, A2B, A3) • P2Y (1, 2, 4, 5, 6, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14)
Serotoninski	(svi osim 5-HT3) 5-HT1 (A, B, D, E, F) • 5-HT2 (A, B, C) • 5-HT (4, 5A, 6, 7)
Drugi	Acetilholin (M1, M2, M3, M4, M5) • Dopamin (D1, D2, D3, D4, D5) • Histamin (H1, H2, H3, H4) • Melatonin (1A, 1B, 1C) • TAAR (1, 2, 3, 5, 6, 8, 9)

Metaboliti i
signalni molekuli

Eikozanoidni	CysLT (1, 2) • LTB4 (1, 2) • FPRL1 • OXE • Prostaglandin (DP (1, 2), EP (1, 2, 3, 4), FP) • Prostaciklin • Tromboksan
Drugi	Žučna kiselina • Kanabinoidni (CB1, CB2, GPR (18, 55, 119)) • EBI2 • Estrogen • Slobodna masna kiselina (1, 2, 3, 4) • Laktat • Lizofosfatidna kiselina (1, 2, 3, 4, 5, 6) • Lizofosfolipid (1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8) • Niacin (1, 2) • Oksoglutarat • PAF • Sfingozin-1-fosfat (1, 2, 3, 4, 5) • Sukcinat

Peptid

Neuropeptidni

B/W (1, 2) • FF (1, 2) • S • Y (1, 2, 4, 5) • Neuromedin (B, U (1, 2)) • Neurotenzin (1, 2)

Drugi

Anafilatoksin (C3a, C5a) • Angiotenzin (1, 2) • Apelin • Bombezin (BRS3, GRPR, NMBR) • Bradikinin (B1, B2) • Hemokin • Holecistokinin (A, B) • Endotelin (A, B) • Formil peptid (1, 2, 3) • FSH • Galanin (1, 2, 3) • GHB receptor • Gonadotropin-oslobađajući hormon (1, 2) • Grelin • Kispeptin • Luteinizirajući hormon/horiogonadotropin • MAS (1, 1L, D, E, F, G, X1, X2, X3, X4) • Melanokortin (1, 2, 3, 4, 5) • MCHR (1, 2) • Motilin • Opioidni (δ, κ, μ, Nociceptin & ζ, ali ne σ) • Oreksin (1, 2) • Oksitocin • Prokineticin (1, 2) • Prolaktin-oslobađajući peptid • Relaksin (1, 2, 3, 4) • Somatostatin (1, 2, 3, 4, 5) • Tahikinin (1, 2, 3) • Tirotropin • Tirotropin-oslobađajući hormon • Urotenzin-II • Vazopresin (1A, 1B, 2)

Razno

Orfan	GPR (1, 3, 4, 6, 12, 15, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 25, 26, 27, 31, 32, 33, 34, 35, 37, 39, 42, 44, 45, 50, 52, 55, 61, 62, 63, 65, 68, 75, 77, 78, 81, 82, 83, 84, 85, 87, 88, 92, 101, 103, 109A, 109B, 119, 120, 132, 135, 137B, 139, 141, 142, 146, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 160, 161, 162, 171, 173, 174, 176, 177, 182, 183)
Drugi	Adrenomedulin • Mirisni • Opsin (3, 4, 5, 1LW, 1MW, 1SW, RGR, RRH) • Proteazom-aktivirani (1, 2, 3, 4) • SREB (1, 2, 3)

Klasa B: Sekretinu slični

Orfan	GPR (56, 64, 97, 98, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 123, 124, 125, 126, 128, 133, 143, 144, 155, 157)
Drugi	Moždano specifični angiogenezni inhibitor (1, 2, 3) • Kadherin (1, 2, 3) • Kalcitonin • CALCRL • CD97 • Kortikotropin-oslobađajući hormon (1, 2) • EMR (1, 2, 3) • Glukagon (GR, GIPR, GLP1R, GLP2R) • Hormon rasta • PACAPR1 • GPR • Latrofilin (1, 2, 3, ELTD1) • Metuzalemski protein • Paratiroidni hormon (1, 2) • Sekretin • Vazoaktivni intestinalni peptid (1, 2)

Klasa C: Metabotropni
glutamat / feromon

Ukus	TAS1R (1, 2, 3) • TAS2R (1, 3, 4, 5, 8, 9, 10, 12, 13, 14, 16, 19, 20, 30, 31, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 45, 46, 50)
Drugi	Kalcijum-detektujući receptor • GABA B (1, 2) • Glutamatni receptor (Metabotropni glutamat (1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8)) • GPRC6A • GPR (156, 158, 179) • RAIG (1, 2, 3, 4) • VNR (1, 2, 3, 5)