BDNF

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1BND, 1B8M

Ідентифікатори

Символи

BDNF, brain-derived neurotrophic factor, ANON2, BULN2, Brain-derived neurotrophic factor, brain derived neurotrophic factor

Зовнішні ІД

OMIM: 113505 MGI: 88145 HomoloGene: 7245 GeneCards: BDNF

Пов'язані генетичні захворювання

ожиріння^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• signaling receptor binding • neurotrophin TRKB receptor binding • growth factor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • perinuclear region of cytoplasm • мітохондрія • nuclear speck • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • extracellular region • міжклітинний простір • Синаптичні бульбашки • аксон • дендрит (нейробіологія)
Біологічний процес	• brain-derived neurotrophic factor receptor signaling pathway • GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process • synapse assembly • cell-cell signaling • positive regulation of brain-derived neurotrophic factor receptor signaling pathway • collateral sprouting • positive regulation of synapse assembly • positive regulation of collateral sprouting • нейробіологія розвитку • axon guidance • negative regulation of myotube differentiation • positive regulation of receptor binding • regulation of protein localization to cell surface • regulation of signaling receptor activity • activation of phospholipase C activity • neurotrophin TRK receptor signaling pathway • positive regulation of non-membrane spanning protein tyrosine kinase activity • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway • peripheral nervous system development • пам'ять • nerve development • nerve growth factor signaling pathway • regulation of neuron differentiation • neuron projection morphogenesis • modulation of chemical synaptic transmission • positive regulation of neuron projection development • negative regulation of apoptotic signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


627


12064

Ensembl


ENSG00000176697


ENSMUSG00000048482

UniProt


P23560


P21237

RefSeq (мРНК)

NM_001143805 NM_001143806 NM_001143807 NM_001143808 NM_001143809
NM_001143810 NM_001143811 NM_001143812 NM_001143813 NM_001143814 NM_001143815 NM_001143816 NM_001709 NM_170731 NM_170732 NM_170733 NM_170734 NM_170735

NM_001048139 NM_001048141 NM_001048142 NM_007540 NM_001285416
NM_001285417 NM_001285418 NM_001285419 NM_001285420 NM_001285421 NM_001285422 NM_001316310

RefSeq (білок)

NP_001137277 NP_001137278 NP_001137279 NP_001137280 NP_001137281
NP_001137282 NP_001137283 NP_001137284 NP_001137285 NP_001137286 NP_001137288 NP_001700 NP_733927 NP_733928 NP_733929 NP_733930 NP_733931

NP_001041604 NP_001041606 NP_001041607 NP_001272345 NP_001272346
NP_001272347 NP_001272348 NP_001272349 NP_001272350 NP_001272351 NP_001303239 NP_031566

Локус (UCSC)

Хр. 11: 27.65 – 27.72 Mb

Хр. 2: 109.51 – 109.56 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

BDNF (англ. Brain derived neurotrophic factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 247 амінокислот, а молекулярна маса — 27 818^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTILFLTMVI	SYFGCMKAAP	MKEANIRGQG	GLAYPGVRTH	GTLESVNGPK
AGSRGLTSLA	DTFEHVIEEL	LDEDQKVRPN	EENNKDADLY	TSRVMLSSQV
PLEPPLLFLL	EEYKNYLDAA	NMSMRVRRHS	DPARRGELSV	CDSISEWVTA
ADKKTAVDMS	GGTVTVLEKV	PVSKGQLKQY	FYETKCNPMG	YTKEGCRGID
KRHWNSQCRT	TQSYVRALTM	DSKKRIGWRF	IRIDTSCVCT	LTIKRGR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до факторів росту. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Секретований назовні.

Література

Jones K.R., Reichardt L.F. (1990). Molecular cloning of a human gene that is a member of the nerve growth factor family. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87: 8060—8064. PMID 2236018 DOI:10.1073/pnas.87.20.8060
Shintani A., Ono Y., Kaisho Y., Igarashi K. (1992). Characterization of the 5'-flanking region of the human brain-derived neurotrophic factor gene. Biochem. Biophys. Res. Commun. 182: 325—332. PMID 1339267 DOI:10.1016/S0006-291X(05)80148-2
Pruunsild P., Kazantseva A., Aid T., Palm K., Timmusk T. (2007). Dissecting the human BDNF locus: bidirectional transcription, complex splicing, and multiple promoters. Genomics. 90: 397—406. PMID 17629449 DOI:10.1016/j.ygeno.2007.05.004
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hallboeoek F., Ibanez C.F., Persson H. (1991). Evolutionary studies of the nerve growth factor family reveal a novel member abundantly expressed in Xenopus ovary. Neuron. 6: 845—858. PMID 2025430 DOI:10.1016/0896-6273(91)90180-8
Robinson R.C., Radziejewski C., Stuart D.I., Jones E.Y. (1995). Structure of the brain-derived neurotrophic factor/neurotrophin 3 heterodimer. Biochemistry. 34: 4139—4146. PMID 7703225 DOI:10.1021/bi00013a001

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з BDNF переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1033 (англ.) . Архів оригіналу за 13 липня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, P23560 (англ.) . Архів оригіналу за 5 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.